旁流水处理器利用特殊材料制成的金属电极，在适当的外加电压作用下，使流经的水产生微电解，使水中溶解的氯离子、氧分子及水分子产生以下氧化性物质：二氧化氯（CLO）、活性氧（O）、双氧水（H传舀）、分子氯（CL）、次氯酸（ClO）等。这些氧化性物质通过水的流动，扩散到所有水经过的地方，杀灭水系统中的细菌、藻类细胞。旁流水处理器 流经水处理器的水中细菌、藻类细胞，因在电流作用下，被直接杀死，活性氧在管道上生成氧化膜，保护设备不被进一步腐蚀，各种微生物腐蚀、沉积腐蚀被抑制。
水经处理后，水分子聚合度降低，结构发生变化，水的偶极距增大，极性增加，所有这些变化，都增加了水的水合能力和溶垢能力。对于已结垢的系统，活性氧将破坏分子间的电子结合力，改变其晶体结构，使坚硬老垢变为疏松软化，积垢逐渐溶解或成碎屑脱落。水中所含的盐类离子Ca2+、Mg2+、CO32-、SO42-等因受到微电流的作用，分别趋向于不同的电极并被重新排列，难于趋向器壁积聚，从而防止水垢生成。